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南京航运学校创办于1956年,隶属于交通部长江航务管理局,学校原名为南京河运学校,1992年5月为适应培养江海两用人才的需要,经交通部批准,更名为南京航运学校.学校位于六朝古都南京市下关区（现鼓楼区）,濒临长江,占地110亩,建筑面积43915平方米,拥有220米水上岸线,建有100米长的码头,校园幽雅,环境优美,是培养航运人才的理想园地.学校现有教职工291人,在校生1993人.专职教师共有95人,其中高级讲师17人,拥有本科学历的教师占教师总数的91,有丰富的教学经验和专业技能.学校先后建立起雷达模拟操纵实验室,海上求生、卫生急救、船舶消防、艇筏操纵训练基地,GPS卫星导航定位实验室,NT网络多功能计算机网络实验室.
2003年7月经江苏省人民政府批准由南京航运学校和南京海运学校合并组建的一所全日制普通高等院校——江苏海事职业技术学院，并另建新校区。南京航运学校这个名字从此退出历史舞台。
江苏海事职业技术学院现有江宁,秦淮（原白下）和板桥等三个校区。
江宁校区是江苏海事职业技术学院的主校区，位于南京江宁大学城，地址：江苏省南京市江宁区格致路309号。
秦淮校区是原南京海运学校校址，现为江苏海院伯利兹科技园，地址：江苏省南京市秦淮区白下路273号。
板桥校区是实践教学基地，地址：江苏省南京市雨花台区雨花经济开发区大胜关。
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