与Piwi蛋白相作用的RNA称为piRNA。piRNAs在基因组中显示出与众不同的定位类型,主要成群地分为长20–90kb的基因簇,其中的长片断的小分子RNA只能来源于单链。相似的piRNAs在人类和小鼠中均有发现,大部分基因簇出现在同一染色体的位置上。虽然piRNA的功能仍然需要研究阐明,但是生殖细胞中的piRNA富集现象和Miwi突变导致的男性不育表明piRNA在配子形成的过程中起作用。
piRNA是指piwi相互作用RNA,是一类内源性小干扰RNA,能特异性地与动物细胞中Argonaute蛋白的类似物PIWI结合。piRNA不能由dsRNA形成。
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